杀菌机工作生产一定时间就需要清洗，清洗间隔时间的长短及清洗是否彻底，都会直接影响产品质量，影响杀菌机的使用效率。杀菌机与其他设备如降膜式蒸发器不同，蒸发器生产清洗完毕可以将蒸发器的上下器盖等直接打开，比较方便，而杀菌机管束较多，容易清洗不彻底，检查会比较困难。近年来由于清洗不到位而影响产品质量的情况比较多见，本文以处理量为1000kg/h的管式杀菌机在胶原蛋白杀菌上的应用为例进行阐述。
物料介质：胶原蛋白浓缩液。
处理量：1000kg/h。
牛奶进入温度：45℃。
牛奶进入干物质含量：45%。
使用蒸汽压力：0.8MPa。
杀菌温度：137℃。
结构特点：本杀菌机为管式杀菌机，生产工艺流程如图1所示。本杀菌机分为杀菌段与冷却段两段，冷却段采用塔水冷却。本机的主要工作过程为：物料→加热杀菌→保持→冷却→出料。在杀菌机中一般只设置酸碱罐（多为PP材料方形桶），水洗可采用启动的热水罐替代，如本例所示。为了清洗彻底，一般清洗流速要高于物料流速。本例物料在管式杀菌机中流速按1m/h设计，水、酸、碱清洗时流速一般是物料流速的两倍或两倍以上的流速，即清洗液流速在2m/s～2.5m/s即可，这样可达到流速快、清洗彻底、效果好的目的。
杀菌机在开机前一般只进行热水清洗，清洗是指凡是与物料接触部位即包括所有物料管道及杀菌冷却回流管道等的清洗，热水的温度为50℃～60℃，本例清洗过程为：原热水→进料管道→加热段换热管道→冷却段换热管道→原水缸→回流管道→物料罐。
清洗时间应根据杀菌机结垢结焦具体情况而定。设备清洗完毕需要将杀菌段换热管端部定期打开观察，如果经过清洗后仍有垢层附着在换热管的管壁表面就应该借助清理工具将其清理掉，然后再进行清洗，这样就能达到清洗彻底的目的。
清洗液在设备内流速的大小与清洗是否彻底有关。清洗流速要高于料液在换热管（或板片之间）中的流速，一般是料液2倍以上的流速。清洗液的配比及清洗时间长短直接影响清洗效果，酸碱配比即Na OH与硝酸清洗液配比一般各占2%～3%，酸碱浓度应由在线酸碱浓度检测仪完成。清洗程序的设定也非常重要，清洗时间的长短是由垢结焦程度决定的，清洗必须严格按照清洗程序及清洗时间才能获得较好的清洗效果。
清洗是杀菌机工作过程中必须的步骤，设备使用一段时间根据杀菌温度的稳定性情况决定是否需要清洗。清洗要彻底不能留死角，此外在清洗完成后还要将换热管端部不定期的打开检查。主要检查杀菌段换热管内清洗后，是否还有未清洗掉的残留物，如果有就要及时清理掉，然后再进行清洗，只有这样才能获得良好工作状态和杀菌效果。
